编辑推荐

实用性强、容易上手的大量示例，教你如何把所学的知识应用于实践。
问答和练习帮助你测试知识的掌握程度，并扩展你的编程技能。

通过阅读《R语言入门经典》，读者可以掌握有助于解决大部分真实的数据分析问题的R基础知识和实用编程技巧。你将掌握整个数据分析流程，学会创建高效、可复用且适合与他人共享的代码。
《R语言入门经典》采用直观、循序渐进的方法进行讲解，旨在帮助读者掌握如何使用R语言进行数据的导入、导出、操控、汇总、建模和绘制。《R语言入门经典》还提供了设计代码的思路，以及如何使用当前的*佳实践来构建强大的R包。
《R语言入门经典》内容：
安装、配置和探索R语言的环境，包括RStudio；
使用基本的R语法、对象和包；
创建和管理数据结构，包括向量、矩阵和数组；
理解列表和数据框；
处理日期、时间和因子；
使用常见的R函数，并学会如何编写自己的函数；
导入和导出数据，连接数据库和电子表格；
使用流行的tidyr、dplyr和data.table包；
通过性能分析、向量化和初始化编写更高效的R代码；
绘制数据，用ggplot2和Lattice图形系统扩展绘图功能；
开发普通类型的模型；
构建高质量的包；
编写R类：S3、S4和引用类；
用R生成动态报告；
用Shiny创建Web应用程序。

内容简介

《R语言入门经典》作为R语言的学习指南，详细讲解了R语言的基本概念和编程技巧。《R语言入门经典》从*基础的知识开始，由浅入深地介绍R的基本概念和重要特性，并用大量的示例和图形进行演示和说明，旨在让读者在掌握R语言的同时，能养成良好的编程习惯，写出专业、高效的代码。
《R语言入门经典》共24章，其内容涵盖了R语言的社区和环境介绍；R语言的各种数据结构（单模式/多模式数据结构，日期、时间和因子）；包括各种常用函数、实用函数和应用函数在内的R语言函数；如何在R中进行文本的导入和导出，如何操控和转换数据，以及在R中高效处理数据的方法；如何可视化数据（涵盖了三个基本图形系统、ggplot2图形系统和Lattice图形系统）；如何用R构建线性模型、广义线性模型和非线性模型，以及面向对象的思想；如何进行R代码提速（包括代码的性能分析和提速方法）；如何构建R包和扩展R包；如何编写R类，其中会涉及R中的面向对象编程系统（S3、S4、引用类等）；如何创建动态报告和如何用Shiny创建网络应用程序。《R语言入门经典》附录还介绍了R、Rtools和RStudio的具体安装步骤。
《R语言入门经典》涵盖了R语言的所有基础知识，介绍了许多实用的编程技巧，既可作为R语言的入门教材，也可作为一本为寻求拓宽分析工具的专业统计学家、数据科学家、分析师量身打造的学习宝典。《R语言入门经典》还可作为对R语言感兴趣的读者和开发人员的参考书籍。

作者简介

AndyNicholls在英国斯巴大学获得数学硕士学位，在南安普顿大学获得统计学应用科学硕士学位。Andy在2011年加入MangoSolution公司之前一直是一位制药行业的资深统计学家。自从加入MangoSolution后，Andy举办了50多次R语言的现场培训课程，参与了30多个R包的开发。现在，他负责管理MangoSolution的R顾问团队，并一直定期为每季度的LondonR活动做贡献。到目前为止，该活动的R用户组参与人数居英国之首，有1000多个见面会成员。Andy与他美丽贤惠的妻子和可爱的儿子居住在英国的历史名城巴斯附近。
RichardPugh在巴斯大学获得数学学位。Richard在制药行业作为统计学家从事统计相关工作多年，后来加入了Insightful公司（开发了S-PLUS）的售前顾问团队。Richard在Insightful公司的工作包括举办各种活动，给许多行业的蓝筹客户提供相关的培训和咨询服务。Richard在2002年作为联合创始人创建了MangoSolution，领导公司中R和其他分析软件的各种项目开发和技术研发。Richard现在是Mango公司的首席数据科学家，定期在数据科学会议和R活动中发言。Richard与他的妻子和两个孩子居住在英国威尔特郡西部的BradfordonAvon镇，大部分“业余时间”都在修整自己的房子。
AimeeGott是兰卡斯特大学的统计学博士，在本校获得了本科和硕士学位。作为培训领导，Aimee为Mango公司举办了200多天的培训。她在欧洲和美国举办了多次全面介绍R语言的现场培训，而且还包括许多短期研讨会和在线研讨会。Aimee负责监督Mango公司跨数据科学领域方面的培训课程开发，并定期参加R用户组和见面会。在业余时里，Aimee喜欢学习各种欧洲语言，并用摄影记录她的旅行。

目录

第1章　R语言社区1

1．1R语言简史1

1．1．1S语言的诞生1

1．1．2R语言的诞生2

1．2R语言社区3

1．2．1邮件列表3

1．2．2R语言手册4

1．2．3在线资源4

1．2．4R语言联盟4

1．2．5用户活动5

1．3R语言的开发5

1．4本章小结6

1．5本章答疑6

1．6课后研习7

1．7补充练习7

*2章　R语言环境8

2．1集成开发环境8

2．1．1RGUI8

2．1．2RStudioIDE9

2．1．3其他开发环境10

2．2R语法10

2．2．1控制台10

2．2．2脚本11

2．3R对象12

2．3．1R包12

2．3．2搜索路径12

2．3．3列出对象13

2．3．4R的工作空间14

2．4使用R包16

2．4．1查找合适的包17

2．4．2安装R包17

2．4．3载入R包19

2．5内部帮助20

2．6本章小结21

2．7本章答疑21

2．8课后研习22

2．9补充练习23

第3章　单模式数据结构24

3．1R的数据类型24

3．2向量、矩阵和数组25

3．3向量25

3．3．1创建向量26

3．3．2向量属性30

3．3．3索引向量32

3．4矩阵36

3．4．1创建矩阵37

3．4．2矩阵属性39

3．4．3索引矩阵41

3．5数组44

3．5．1创建数组44

3．5．2数组属性45

3．5．3索引数组45

3．6单模式数据对象之间的关系46

3．7本章小结47

3．8本章答疑47

3．9课后研习48

3．10补充练习49

第4章　多模式数据结构50

4．1多模式结构50

4．2列表51

4．2．1列表是什么51

4．2．2创建空列表52

4．2．3创建非空列表52

4．2．4创建有元素名的列表53

4．2．5创建列表：总结53

4．2．6列表属性54

4．2．7索引列表55

4．2．8索引列表的子集55

4．2．9引用列表的元素58

4．2．10添加列表元素60

4．2．11列表语法总结61

4．2．12为何要学习列表63

4．3数据框66

4．3．1创建数据框66

4．3．2查询数据框的属性67

4．3．3选取数据框的列67

4．3．4添加数据框的列67

4．3．5索引数据框的列68

4．3．6作为矩阵引用69

4．3．7索引数据框总结71

4．4探索数据71

4．4．1数据的顶部和底部72

4．4．2数据视图72

4．4．3汇总数据74

4．4．4可视化数据74

4．5本章小结75

4．6本章答疑75

4．7课后研习77

4．8补充练习78

第5章　日期、时间和因子80

5．1处理日期和时间80

5．1．1创建日期对象80

5．1．2创建包含时间的对象81

5．1．3操控日期和时间82

5．2lubridate包83

5．3处理分类数据84

5．3．1创建因子84

5．3．2管理因子的水平86

5．3．3创建连续数据的因子86

5．4本章小结87

5．5本章答疑88

5．6课后研习88

5．7补充练习89

第6章　常用R函数90

6．1R函数的用法90

6．2处理数值数据的函数91

6．2．1数学函数和运算符91

6．2．2统计汇总函数92

6．2．3模拟和统计分布93

6．3处理逻辑数据的函数94

6．4处理缺失数据的函数95

6．5处理字符数据的函数96

6．5．1处理简单的字符96

6．5．2查找和替换97

6．6本章小结98

6．7本章答疑98

6．8课后研习98

6．9补充练习99

第7章　编写函数：*一部分100

7．1为何要学习函数100

7．2创建简单的函数101

7．2．1命名函数102

7．2．2定义函数的参数103

7．2．3函数作用域规则104

7．2．4返回对象104

7．3If/Else结构106

7．3．1一个简单的R示例107

7．3．2嵌套语句108

7．3．3使用一个条件108

7．3．4多个测试值109

7．3．5汇总成一个逻辑值109

7．3．6简化逻辑输入110

7．3．7反转逻辑值111

7．3．8混合条件112

7．3．9控制与/或语句112

7．3．10提前返回113

7．3．11示例114

7．4本章小结115

7．5本章答疑115

7．6课后研习116

7．7补充练习117

第8章　编写函数：*二部分119

8．1错误和警告119

8．1．1错误消息120

8．1．2警告消息121

8．2检查输入122

8．3省略号124

8．3．1使用省略号125

8．3．2用省略号传递图形参数125

8．4检查多值输入128

8．5使用输入定义130

8．6本章小结133

8．7本章答疑133

8．8课后研习134

8．9补充练习135

第9章　循环和汇总136

9．1重复的任务136

9．1．1循环136

9．1．2for循环137

9．1．3while循环142

9．2“应用”函数家族143

9．3apply()函数144

9．3．1MARGIN144

9．3．2简单的apply()用例145

9．3．3使用多个MARGIN146

9．3．4更高维结构使用apply()147

9．3．5给“待应用”函数传递

其他参数148

9．3．6在自定义函数中使用apply()150

9．3．7给函数传递额外参数151

9．3．8应用于数据框152

9．4lapply()函数153

9．4．1split()函数154

9．4．2分割数据框155

9．4．3用lapply()函数处理向量157

9．4．4“应用”输入的次序158

9．4．5用lapply()函数处理数据框160

9．5sapply()函数161

9．5．1从sapply()返回162

9．5．2为何要使用sapply()164

9．6tapply()函数165

9．6．1多个分组变量165

9．6．2多值返回166

9．6．3从tapply()返回值168

9．7本章小结169

9．8本章答疑169

9．9课后研习170

9．10补充练习171

*10章　导入和导出172

10．1处理文本文件172

10．1．1读入文本文件173

10．1．2读入CSV文件174

10．1．3导出文本文件175

10．1．4更快导入和导出175

10．1．5高效数据存储175

10．1．6所有权和其他格式176

10．2关系数据库177

10．2．1RODBC177

10．2．2DBI178

10．3操作MicrosoftExcel179

10．4本章小结183

10．5本章答疑183

10．6课后研习184

10．7补充练习184

*11章　数据操控和转换186

11．1排序186

11．1．1数据框排序187

11．1．2降序排列187

11．2附加188

11．3合并188

11．3．1合并示例189

11．3．2缺失值190

11．4重复值191

11．5重组192

11．5．1用reshape进行重组192

11．5．2融合193

11．5．3重铸194

11．5．4用tidyr进行重组195

11．6数据整合197

11．6．1使用“for”循环197

11．6．2使用“应用”函数198

11．6．3aggregate()函数199

11．6．4使用带公式的aggregate()199

11．6．5根据指定列使用aggregate()201

11．6．6计算baseline的差值203

11．7本章小结204

11．8本章答疑204

11．9课后研习205

11．10补充练习205

*12章　高效数据处理206

12．1dplyr：处理数据的新方式206

12．1．1创建dplyr（tbl_df）对象207

12．1．2排序208

12．1．3访问子集208

12．1．4添加新列210

12．1．5合并211

12．1．6整合212

12．1．7管道操作符215

12．2用data．table高效处理数据216

12．2．1创建data．table216

12．2．2设置key217

12．2．3取子集217

12．2．4添加新行和新列219

12．2．5合并221

12．2．6整合222

12．2．7处理超大数据集的其他包223

12．3本章小结224

12．4本章答疑224

12．5课后研习224

12．6补充练习225

*13章　图形226

13．1图形设备和颜色226

13．1．1设备226

13．1．2颜色227

13．2高级图形函数227

13．2．1单变量图形函数228

13．2．2plot()函数230

13．2．3图形属性231

13．3初级图形函数235

13．3．1点和线235

13．3．2文本236

13．3．3图例237

13．3．4其他初级函数239

13．4图形参数239

13．5控制布局240

13．5．1网格布局240

13．5．2layout()函数241

13．6本章小结242

13．7本章答疑242

13．8课后研习243

13．9补充练习244

*14章　ggplot2图形包245

14．1ggplot2的哲学245

14．2快速绘图和基本控制246

14．2．1使用qplot()246

14．2．2标题和轴247

14．2．3使用图层247

14．2．4把图形作为对象248

14．3更改绘制类型249

14．3．1绘制类型249

14．3．2组合绘制类型251

14．4图形属性251

14．4．1控制图形属性252

14．4．2标度和图例254

14．4．3处理分组数据256

14．5面板（分面）257

14．5．1facet_grid()的用法258

14．5．2facet_wrap()的用法259

14．5．3从qplot()中进行分面260

14．6定制绘图260

14．6．1ggplot()260

14．6．2坐标系264

14．7主题和布局265

14．7．1调整单个绘图265

14．7．2全局主题266

14．7．3图例布局266

14．8ggvis的演变267

14．9本章小结267

14．10本章答疑268

14．11课后研习268

14．12补充练习269

*15章　lattice图形270

15．1格子图形的历史270

15．2lattice包271

15．3创建简单的lattice图形271

15．3．1lattice图形类型272

15．3．2绘制数据的子集277

15．4图形选项278

15．4．1标题和轴278

15．4．2绘制类型和格式279

15．5多变量280

15．6数据的分组281

15．7使用面板282

15．7．1控制条头283

15．7．2多个“By”变量284

15．7．3面板函数285

15．8控制样式290

15．8．1预览样式291

15．8．2创建主题292

15．8．3使用主题293

15．9本章小结294

15．10本章答疑294

15．11课后研习295

15．12补充练习295

*16章　R模型和面向对象296

16．1R中的统计模型296

16．2简单的线性模型296

16．3在R中评估模型298

16．3．1模型汇总298

16．3．2模型诊断图299

16．3．3提取模型元素300

16．3．4作为列表对象的模型302

16．3．5在绘图中添加模型线304

16．3．6模型预测305

16．4多元线性回归306

16．4．1更新模型306

16．4．2比较嵌套模型307

16．5交互项309

16．6因子自变量311

16．7变量转换314

16．8R和面向对象316

16．8．1面向对象316

16．8．2线性模型方法317

16．9本章小结318

16．10本章答疑318

16．11课后研习319

16．12补充练习319

*17章　常见R模型320

17．1广义线性模型320

17．1．1GLM定义321

17．1．2拟合GLM模型321

17．1．3拟合高斯模型322

17．1．4glm对象323

17．1．5Logistic回归325

17．1．6泊松回归327

17．1．7GLM扩展329

17．2非线性模型329

17．2．1非线性回归330

17．2．2非线性模型扩展335

17．3生存分析336

17．3．1ovarian数据框336

17．3．2删失数据336

17．3．3估计生存函数337

17．3．4比例风险341

17．3．5生存模型扩展344

17．4时间序列分析344

17．4．1时间序列对象344

17．4．2分解时间序列346

17．4．3平滑347

17．4．4自相关349

17．4．5拟合ARIMA模型349

17．5本章小结352

17．6本章答疑352

17．7课后研习352

17．8补充练习353

*18章　代码提速354

18．1确定效率354

18．1．1性能分析355

18．1．2标准分析工具355

18．2初始化356

18．3向量化357

18．3．1什么是向量化358

18．3．2怎样编码可以向量化358

18．4使用替换函数360

18．5管理内存使用360

18．6集成C++361

18．6．1C++和Rcpp的使用时机361

18．6．2基本函数362

18．6．3在C++中使用R函数364

18．7本章小结364

18．8本章答疑365

18．9课后研习365

18．10补充练习366

*19章　构建包367

19．1为什么要构建R包367

19．2R包的结构368

19．2．1创建包的结构368

19．2．2DESCRIPTION文件369

19．2．3NAMESPACE文件370

19．2．4R目录370

19．2．5man目录371

19．3代码质量371

19．4用roxygen2自动创建文档372

19．4．1函数的roxygen注释块372

19．4．2撰写包的文档374

19．4．3创建和更新帮助页面374

19．5用devtools构建包375

19．5．1检查375

19．5．2构建377

19．5．3安装377

19．6本章小结378

19．7本章答疑378

19．8课后研习378

19．9补充练习379

*20章　构建高级包380

20．1扩展R包380

20．2开发测试框架381

20．2．1testthat介绍381

20．2．2将测试合并进包中383

20．3在包中包含数据384

20．4包含用户指南386

20．4．1在包中包含使用指南386

20．4．2撰写使用指南387

20．5用Rcpp编码389

20．6本章小结390

20．7本章答疑390

20．8课后研习391

20．9补充练习391

*21章　编写R类393

21．1什么是类393

21．1．1R中的面向对象394

21．1．2为何要用面向对象394

21．1．3为何要使用S3396

21．2创建新的S3类396

21．3泛型函数和方法398

21．3．1为算术操作符定义方法399

21．3．2列表和属性400

21．3．3创建新的泛型401

21．4在S3中继承402

21．5创建S3文档403

21．6S3的局限性403

21．7本章小结404

21．8本章答疑404

21．9课后研习404

21．10补充练习405

*22章　正式的类系统406

22．1S4406

22．1．1使用S4类407

22．1．2定义S4类407

22．1．3方法410

22．1．4定义新的泛型函数411

22．1．5多重分派412

22．1．6继承413

22．1．7创建S4的文档414

22．2引用类415

22．2．1创建新的引用类415

22．2．2定义方法417

22．2．3复制引用类的对象419

22．2．4创建引用类的文档420

22．3R6类421

22．3．1公有成员和私有成员421

22．3．2R6示例421

22．4其他类系统422

22．5本章小结422

22．6本章答疑423

22．7课后研习423

22．8补充练习424

*23章　动态报告425

23．1什么是动态报告425

23．2knitr包简介426

23．3用RMarkdown生成

简单的报告426

23．3．1RMarkdown文档基础426

23．3．2创建HTML文件427

23．3．3包含R的代码和输出428

23．4用LaTeX生成报告430

23．4．1LaTeX文档基础430

23．4．2在LaTeX文档中包含代码431

23．5本章小结433

23．6本章答疑433

23．7课后研习433

23．8补充练习434

*24章　用Shiny创建网络应用程序435

24．1简单的Shiny应用程序435



24．1．1Shiny应用程序的结构435

24．1．2ui组件436

24．1．3server组件437

24．2响应式函数439

24．2．1为何需要响应式函数439

24．2．2创建一个简单的响应式函数440

24．3交互式文档441

24．4共享Shiny应用程序442

24．5本章小结442

24．6本章答疑443

24．7课后研习443

24．8补充练习444

附录A　安装445

精彩书摘

　　《R语言入门经典》：
　　如果想添加元素（如主标题、轴范围、轴标签），必须用额外的图层才行。从本质上看，这种通过添加图层的方式来绘制图形的方法就是图形语法。
　　1.aes（）函数
　　对于ggplot2包的新成员，aes（）函数是需要重点理解的地方。我在进行R培训时得知，那些使用ggplot2包多年的人仍对这个函数的用法和使用时机一知半解！实际上，只需记住一条规则就行，学会以后用起来非常简单直接。首先，我们来看aes的含义，以及该函数是从哪里来的。
　　在图形语法中，“图形属性”不仅指点在图形中的外观，而且还涉及点本身。实际上，它涉及点的方方面面。图形语法把绘制类型定义为几何形状或“几何”（geom）”，所谓的点可以是线、箱或条形。图形属性的本质就是一些信息，反映了如何表示数据中的变量（或者用图形语法的术语，如何“映射”数据中的变量）。这些图形属性取决于绘制类型、坐标系、分面和标度等。
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